如果不及时清洁，就会使盘管中冷热水与盘管外流过的空气之间的热交换量减少，使盘管的换热效能不能充分发挥出来。如果附着的粉尘很多，甚至将肋片间的部分空气通道都堵塞的话，则同时还会减少风机盘管的送风量，使其空调性能进一步降低。

清洁方式可参照空气过滤器的清洁方式进行，但清洁周期可以长一些，一般一年清洁一次。如果是季节性使用的空调，则在空调使用季节结束后清洁一次。不到万不得已，不采用整体从安装部位拆卸下来清洁的方式，以减少清洁工作量和拆装供职造成的影响。

风机盘管做为中央空调的末端设备，其质量的好坏决定了室内的空调效果。同时，其清洗问题也直接影响着中央空调的使用效果。大气中的灰尘微粒很多，在长期的抽、回风作用下，风机的铝翅片积满了灰尘污垢，此时一方面影响了冷冻水与热空气的热交换使空气温度下降受影响；另一方面还影响了经热交换后有所降温的冷空气的送出，造成开了空调而房间仍然不冷的现象。因为中央空调主机经过制冷后把7度的水送进风机盘管，在风机盘管内进行交换后成为15--16度的冷风，这样使房间温度降低的。所以，中央空调在使用了一段时间后，就必须对风机铝翅片进行清洗以解决上述弊端。